قامت قوة أمنية من قسم ميت غمر بضبط ميرفت مصطفى والقبض عليها في 28 يناير 2014 وذلك بعد تحرير محضر ضدها من قبل مديرة الدكتور فتحي على حسن مطر مدير العيادات يفيد بقيام الدكتورة بالتجول بالمستشفى شاهرة علامة رابعة الخاصة بجماعة إرهابية بوضعها على ملابسها، فضلاً عن محاولات الشغب وتعطيل العمل، مما أثارت غضب العاملين بالمستشفى والمترددين من المرضى وأهاليهم. وتحرر عن ذلك المحضر رقم 344 إداري قسم شرطة ميت غمر وتم عرضها على النيابة التي وجهت لها تهم التعدي بالقول وألفعل على موظفين عموميين وأحراز مطبوعات الغرض منها تكدير الأمن العام والإضرار بالمصلحة العامة للبلاد وأمرت بحبسها على ذمة التحقيقات. حكم عليها في 23 فبراير 2014 بالسجن عامين وكفالة 200 جنيه، وقامت بتسديد الكفالة وإخلاء سبيلها لحين الحكم في الاستئناف والذي أكد الحكم 1 مارس 2014.
انتهاكات تعرضت لها:
-تعرضت للضرب والسب على يد ضابط داخل المستشفى قبل القبض عليها.