تم القبض على ميرفت حسين من المنزل في 26 يناير 2016 بناء على أمر ضبط وإحضار في القضية رقم 1303 لسنة 2016 جنح أمبابه وحصلت على إخلاء سبيل في 6 فبراير 2016 بكفالة ألفين جنيه ثم حصلت على البراءة في 11 يوليو 2016 من الدائرة 21 ارهاب بمحكمة شمال الجيزة.
-تم القبض عليها أيضاً من وقفة أهالي المخفيين قسريا في يوليو 2016 و تم إطلاق سراحها دون تحرير محضر.
-تم القبض عليها مرة أخرى من المنزل في 5 يوليو 2018 في القضية رقم 441 لسنة 2018 أمن دولة بتهم نشر أخبار كاذبة عن الأوضاع السياسية والإقتصادية بالبلاد بقصد تكدير السلم العام في اطار أهداف جماعة الإخوان الإرهابية، والترويج لأغراض الجماعة التي تستهدف زعزعة الثقة في الدولة المصرية ومؤسساتها وسجنت في سجن القناطر حتى حصلت على إخلاء سبيل بتدابير احترازية في 16 أكتوبر 2018 و تم الغاء التدابير الاحترازية في 17 فبراير 2020.